Il Seraphicum consta di due realtà distinte, dotate di una particolare autonomia.
La Comunità stabile
formata dai frati che svolgono il servizio di docenza presso la Pontificia Facoltà di “San Bonaventura” o altri servizi dell’Ordine e dai frati formatori.
Il Collegio internazionale
costituito dai frati studenti che dimorano per qualche anno al Seraphicum e frequentano o la Facoltà Teologica “San Bonaventura” oppure altre Facoltà Pontificie romane.


L’unità della comunità è comunque «vissuta nel sentirsi un’unica Fraternità dotata della stessa vocazione e dedita allo stesso impegno specifico: la formazione intellettuale… che informa la preghiera, la vita comunitaria, il lavoro e i diversi impegni» (Stat. 5,6).